La Fédération Régionale de Bourgogne et du Jura a été créée en 1988, Syndicat de métier, elle regroupe 4 Fédérations Départementales : la Fédération de Côte d’Or, la Fédération du Jura, la Fédération de Saône et Loire et la Fédération de l’Yonne.
Elle a pour rôle de défendre les intérêts moraux et matériels de ses adhérents au niveau de la région, étudier les questions professionnelles, économiques et sociales concernant l’activité régionale des adhérents, rechercher les moyens de résoudre les problèmes de ses adhérents, coordonner l’action des Fédérations auprès des Pouvoirs Publics, des organisations nationales et internationales, toujours dans le domaine des activités régionales, ou de participer à leur création, susciter toutes actions économiques tendant à organiser la production, ainsi qu’à faciliter la commercialisation des produits des vignerons vinifiant en Caves Particulières, notamment dans l’organisation de manifestations commerciales.